马来西亚自然协会（Malaysian Nature Society），原名为马来亚自然协会，总部位于马来西亚首都吉隆坡。其在新加坡的分支机构于1991年更名为自然协会（新加坡）。和马来西亚其他很多组织机构一样，它的成立比马来西亚国家独立还要早17年。协会的发起人是当时英国驻马总代办的大批自然爱好者。爱好自然的英国侨民当时记下了大量关于马来半岛自然的重要笔记。《马来西亚自然杂志》于1940年8月出版，同年，马来亚自然协会诞生。
协会的标志是已经被世界自然保护联盟列入濒临灭绝的稀有物种名单的马来貘。马来貘分布在贯穿印度尼西亚、马来西亚、泰国以及缅甸的苏门答腊岛和马来半岛。最后一次报告发现马来貘是在马来西亚和印度尼西亚接壤的婆罗洲。遗憾的是，这样的报告还没有得到证实。
协会的第一个项目可以追溯到上个世纪60年代，Balasingam博士发起的海龟产卵习性研究项目。这是马来西亚第一次研究海龟产卵习惯。该项计划后来由当时的渔业部接手。1977年，协会联合其他五家组织，在全国发行的报纸上刊登半版广告，发起全国范围内的拯救兴楼云冰国家公园的运动。如今的兴楼云冰国家公园是马来半岛不可多得的低地森林公园之一，已成为包括鹿、象、豹、老虎及罕见的苏门答腊犀牛在内的许多动物的原始家园。古树撑天， 潺潺流水的兴楼云冰国家公园也是今日马来西亚最值得到访的旅游景点之一。
1993年是协会具有里程碑纪念意义的一年。协会开展了由马来西亚最高元首阿兹兰主持的马来西亚遗产及科学考察项目。项目组协助霹雳州州政府记录了该地区丰富的动植物物种，同时收集了大量数据。2007年，该地区被命名为柏隆皇家公园，以保护霹雳州珍贵的自然生态。马来西亚自然协会感到自豪的是，在协会的努力推动下，2007年9月15日，马来西亚自然资源和环境部部长阿兹米宣布将鱼翅从马来西亚政府菜单上剔除。这也是马来西亚自然协会鲨鱼保护运动的成果之一。
可以说，作为一家非盈利机构，马来西亚自然协会深知其运作和广大志愿者的积极参与以及各界组织、团体的贡献是密不可分。自然协会和马来西亚联邦政府、州政府、社区、媒体以及其他有关自然、环境的国际间非政府组织等保持着良好的关系。
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